《名侦探柯南》中，要说破案，毛利小五郎少不了，当然背后还是靠柯南来解决才可以，但是有时候小五郎还是能一展拳脚的，毕竟之前也是做过刑警工作的，那为什么后来开了私家侦探呢？
这件事的起因，还得从小兰上学的时候开始讲起。在剧场版《第十四番目的》中，柯南小兰和小五郎遇到了连续杀人事件，小五郎和妃英里也被小兰糊弄这约会，发生事件后，小五郎也陷入了沉思，毕竟凶手都是和自己有关系的人。
随后柯南和小兰坐着白鸟警官的车回家，在路上白鸟道出了真相，小兰当时问他为什么我爸爸辞去了警察的工作，白鸟表示：你父亲以前是个很厉害的刑警，尤其是枪法非常厉害，在这个警部中是数一数二的，但是在执行任务的时候发生了失误。当时凶手被抓起来在警局中，以上厕所为借口将另一名警察打晕，随后抓了你母亲妃英里当人质，小五郎用手枪指着凶手，想对他进行射击，没想到打中了你母亲的腿部擦伤，凶手见此情况也是逃跑，随后被抓回来。
因为误伤人质这件事，小五郎被审讯，随后放下手枪和警察的工作，开了自己的侦探事务所。
在剧场版最后，才真正了解为什么射伤人质这件事，凶手肯定不敢对人质下手，毕竟就一个人质，如果下毒手，警方肯定一拥而上，自己命都保不住了，这时候人质腿部受伤，无法行动，很不方便，凶手带着她就是个累赘，无奈只能放弃人质自己逃跑。
另外这部剧场版片尾彩蛋也是很有趣，里面解释了小五郎分居的原因。小兰当时问妃英里，原来这就是你们分居的理由啊，妃英里回答道：才不是呢，我不可能因为这个就分居啊，是这样的，有一天晚上我看他很辛苦，我做好饭等他回家，没想到被臭骂一顿，说我受伤了还做什么饭，好好休息去，从此我就觉得他脾气太爆炸了，我还是自己过的舒服点。
虽然是分居，但两人并没有离婚，每一次两人见面都是仇恨，但其实感情是很好的，很多次小五郎都是很关系自己的老婆。在最近的剧情中，妃英里被劫匪绑架，小五郎二话不说直接冲出去找她，两人见面后也是挺温馨的。
说实话，毛利小五郎一开始特别惨，本来辞职想开了侦探事务所，没想到中间冒出来了个工藤新一，被称为高中生侦探，这一下自己什么委托都没有，不过好在琴酒帮了个大忙，把新一变成柯南，柯南利用变声器配合毛利小五郎破案，此后小五郎的名气大增，名侦探的称号也就有了。
