电影将故事的主场放在了香港法医中心，三名持枪悍匪在一个夜深人静的雨夜突袭闯入中心，劫持法医试图在一具尸体上找回一颗遗留的子弹证据，带有子弹的尸体也成为了电影所言的“沉默的证人”。面临穷凶极恶的悍匪，在没有任何防备和支援的境况下，张家辉饰演的法医陈嘉豪和杨紫饰演的实习生不得不与之斡旋，一场发生在封闭空间里的对决成为了电影的张力所在。
《沉默的证人》的可看之处也在于此。全片时间94分钟，面对不大的格局，导演雷尼·哈林紧凑的快节奏其实在伊始赋予了电影以很好的代入感，而随着这场警匪对决的推进，本处于弱势的法警二人组，利用自身知识和对法医中心的熟识，也逐步扭转了自己手无寸铁的劣势，甚至展开了反杀，而被激怒的悍匪无疑也变得更加丧心病狂了起来，不曾间断的冲突如若不是因剧情难以自洽的诟病，《沉默的证人》未尝不会是一部佳作。
从成片来看，不大的格局既为电影构建了一个供警匪争锋的密室，同样也更为苛求电影是否能拿出一个合理的故事。《沉默的证人》最明显的问题便是对任贤齐饰演为首的反派上，前篇本来悍匪的目标是子弹这一证据，自然开枪在电影中就成为了一个本不能滥用的限制，悍匪自己在开始也说出了这一问题，结果后篇一言不对就开枪杀人。前篇匪徒戴面具的动机是为了不让人识破，后篇却自己摘下了面具？！种种自相矛盾的设定使电影整体看来根本没有起码的逻辑构思。
在张家辉与杨紫两人饰演的法医上，电影同样没能给出多好的人物张力，明明已然拥有了逃跑机会的两人，却磨叽的等待着反派的又一次到来，而两人过强的主角光环也使电影最终落入了俗套，甚至某些桥段让人不禁为之尬笑。两人需不需要跑，如何跑的问题其实本该只是电影诱人深入剧情的引子，但在《沉默的证人》里这却几乎成为了电影的全部，单薄的剧情使电影失去了更进一步的可能。
作为曾执导过《虎胆龙威2》的雷尼·哈林，他对动作片节奏的掌控固然轻车熟路，但一件看似新颖的法医空壳并不足以掩盖《沉默的证人》的问题，没有悬疑的法医噱头，不胜枚举的剧情缺陷，终使电影难逃香港动作片那已然乏善可陈的套路。
